Для биологической защиты растений от вредителей используют различных энтомофагов — насекомых-хищников, питающихся другими насекомыми. Чтобы регулировать их численность применяются грибы, бактерии, вирусы, простейшие круглые черви, птицы, млекопитающие, но преимущественно насекомые.
Очень большое число микробов-антагонистов содержится в почве — это способствует ее оздоровлению и защите растений от вредных инфекций. Нужно только правильно подобрать растения в смешанных посадках или в качестве предшественников. Например, больше микроорганизмов-антагонистов накапливается в почве, если сеять злаковые или бобовые смеси, или использовать крапиву, чистотел, мяту, бархатцы, тмин, кориандр, базилик. Внесенные в почву измельченные части этих растений или водная вытяжка из них оказывает такое же действие.
Важно, что биологический метод защиты растений оказывает свое действие много лет. Создание благоприятных условий повышает количество энтомофагов. Для яйцеедов и коровок устраивают укрытия для зимовки. Повышают плодовитость многих полезных паразитов и хищников-насекомых такие растения, как фацелия, горчица, люпин, семенники моркови, лука, укропа.
Также против вредителей сельскохозяйственных растений используют микроорганизмы (вирусы, грибы, бактерии) — возбудители болезней, например, препарат Энтобактерин. Он успешно борется практически со всеми гусеницами бабочек, повреждающих листья сельско-хозяйственных растений. С колорадским жуком борется грибковый препарат Боверин. Против белокрылки используют паразитический гриб Ашерсония. В борьбе с гусеницами, повреждающими лесные лиственные породы, эффективен вирусный препарат Вирин.
Полезные микроорганизмы также с успехом применяются против грибковых болезней растений. Например, против мучнистой росы можно использовать настой прелого сена или коровьего навоза — бактерии, которые в них развиваются, питаются грибницей мучнистой росы.
Биологические средства защиты растений являются безопасными для людей и теплокровных животных. В их основе — враждебные отношения некоторых микроорганизмов по отношению к другим, подавляющие их жизнедеятельность.